Após a etapa do Pré-discipulado o candidato aprovado para o ingresso ao Discipulado faz a experiência dos discípulos de Jesus, crescendo na intimidade junto ao Mestre numa busca contínua da Sua vontade.
Por um período de um ano, o discípulo é acompanhado por uma equipe de formação que o ajuda neste tempo de maior aprofundamento no Carisma, o auxiliando a viver, concretamente, a proposta de formação que tem por base os documentos da Comunidade, os Estatutos que a regem e sua história.
O tempo do Discipulado se dá na casa de formação de Queluz, SP, local que é considerado o “Santuário do Carisma” onde deu-se o início da comunidade Canção Nova no ano de 1978.